腸病毒疫情持續升溫，台北市門急診就診人次已連續3週突破流行閾值960人次。台北市府7月13日公告疫情進入流行警訊期，教托育機構應依規定落實通報及停課作為，否則將依違反傳染病防治法處3千元以上、1萬5千元以下罰鍰。而高雄市則出現首例茲卡病毒感染症確診案例，為今(2017)年國內第2例境外移入茲卡個案。
依健保資料顯示，台北市第24至27週(6月11日至7月8日)腸病毒門急診就診分別為916、1,058、1,132及1,194人次，顯示疫情高峰即將到來。台北市衛生局疾病管制科長陳少卿表示，公告流行警訊期間，依台北市腸病毒通報及停課、停托作業規定，幼兒園、托嬰中心、補習班及兒童課後照顧服務中心等，同一班級在7日內有2名(含)以上幼童，經醫師診斷為手足口、疱疹性咽峽炎或腸病毒感染時，該班級應採停課措施。
若台北市公布出現本土腸病毒感染併發重症病例時，班上出現1名確診為腸病毒71型個案時應停課，同時澈底加強以稀釋漂白水消毒課桌椅、玩具、書本、遊樂設施、娃娃車、保健室、尿布檯及廁所等幼童接觸環境。
根據疾病管制署傳染病統計資料顯示，腸病毒感染併發重症個案全國通報38例，確診5例，北市通報10例，9例排除重症，1例檢驗中。腸病毒目前無抗病毒藥物，勤洗手為預防腸病毒最有效的方法。擤鼻涕後、吃飯前、看病後、接觸幼兒前、如廁後，應使用洗手乳或肥皂搓洗20秒，沖洗乾淨後使用衛生紙或個人擦手巾擦乾，勿與人共用毛巾。
台北市衛生局提醒，若發現幼童疑似手足口症、疱疹性咽峽炎或腸病毒感染幼童，應請假在家休息，避免出入公共場所。同時應留意腸病毒感染併發重症前兆，像是嗜睡、肌躍型抽搐、持續性嘔吐、呼吸急促或心跳加快，務必儘速至腸病毒重症責任醫院(台北市共9家：台大、北榮、三總、北醫、馬偕、國泰、新光、聯醫和平婦幼院區、萬芳)或大醫院就醫，以免延誤病情。
另外，疾病管制署公布高雄市出現首例茲卡病毒感染症確定病例，是一名15歲少年，感染地為越南，是今年國內第2例境外移入茲卡個案。6月30日他與家人前往越南，7月10日陸續出現發燒、紅疹等症狀，11日由小港機場入境時因發燒遭機場檢疫人員攔檢採血，返家後隔日就醫並收治住院，經通報檢驗確認感染茲卡病毒。目前症狀改善住院治療中，將採取防蚊隔離措施至17日，其他同行及同住接觸者均無疑似症狀，衛生單位將持續追蹤健康情形。
疾管署表示，從去(2016)年至今，國內共有15例茲卡確定病例，均為境外移入，感染國家為泰國4例、越南3例、馬來西亞2例，印尼、新加坡、聖露西亞、聖文森及格瑞那丁、美國(佛州邁阿密)及安哥拉各1例。由於國內出現自越南移入確定病例，評估該國目前應有流行及感染風險，因此提升越南茲卡病毒旅遊疫情建議至第二級警示(Alert)。
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