國內疫情再現危機，驚傳3名長榮機師「突破性感染」，民眾擔心華航、諾富特事件重演。今(3)天新增6例新冠肺炎確定病例，分別為2例本土及4例境外移入，無新增死亡個案。累計16,012例確診，本土14,531例、境外移入1,428例，累計837例病歿。
新增2例本土病例中，1例為新北市50多歲女性，8月26日至9月1日因出現咳嗽、流鼻水、發燒、腹瀉、味覺異常及喉嚨痛等症狀多次就醫，9月2日再次就醫，採檢後確診、Ct值25；已匡列1名人接觸者列居家隔離，其餘接觸者匡列中。
另1案為桃園市10多歲男性，為其中1名長榮航空確診機師的兒子，8月30日自覺有疑似中暑症狀，9月1日喉嚨痛，9月2日由衛生單位安排採檢，於今日確診、Ct值11；相關接觸者匡列中。
新增4例境外移入，分別2例自美國入境，泰國及澳大利亞各1例。其中第16119案、16120案為長榮航空機師，2人皆為施打完2劑AZ疫苗的突破性感染，目前正在等候基因定序結果；還有1例51歲女性在美施打兩劑BNT疫苗仍確診、Ct值32。
由於這波本土疫情從華航、諾富特擴散開來，這次長榮航空突破性感染，讓全台民眾繃緊神經，憂心Delta病毒進入校園，造成好不容易趨緩的疫情再爆發。中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中指出，過去校內1人確診全班停課，2人確診全校停課，但此案例高度懷疑是Delta，因此謹慎處理進行全校停課。
桃園市府公布遭機師父親傳染的10多歲學生足跡，8月29日下午前往桃園展演中心藝文廣場、9月1日到裕豐汽車保養廠。學校同班同學34人、老師3人，同學、老師的同住家人105人，計142人須入住集中檢疫所，全校師生共2,845人受影響。桃園市長鄭文燦表示，2名機師在入境PCR採檢後，卻有活動史和接觸史，涉及違規部分將和新竹縣、苗栗縣衛生局一起調查。
長榮機師確診事件使得防疫拉警報，疫情指揮中心宣布，「強化機組員返台後防檢疫規定」提前至9月3日全面實施。這起長榮航空及家人群聚事件，長榮航空匡列64人採檢，包括飛芝加哥的機組員一律居檢14天，並召回8月21日到9月3日飛該航點的機組員，一律採檢。
桃園市機師職業工會表示，3月與7月與航空公司開會時曾反映，包括芝加哥、安克拉治、布里斯本等外站作業人員上機未配戴口罩，然而航空公司卻說「無法強制要求外站人員配戴口罩」。在疫情高風險國家長時間執勤的風險，不應僅由基層機組員承擔，呼籲疫情指揮中心與航空公司應儘速完成調查。
因應境外移入Delta變異株疫情，即日起至9月9日桃園市、新竹市、新竹縣防疫等級提升為強化COVID-19第二級疫情警戒。民眾落實集會活動人數上限降為室內50人，室外100人；賣場與超市加強人流管制；醫院及長照機構除例外情形，停止開放探病及探視，陪病及陪伴者限1人。
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