國內新冠肺炎疫情上升幅度趨緩，週增幅僅約0.2%，不過面臨台商返鄉，防疫工作仍不可輕忽。今(6)天新增2萬7,676例確定病例，分別為本土2萬7,281例及395例境外移入，累計確診者突破900萬大關；中重症180例，再添62例死亡。我國自今(2023)年元旦起，針對大陸入境航班乘客執行PCR篩檢，最新基因定序結果以BA.5.2、BF.7變異株居多，都是常見病毒。
本土COVID-19新增病例比昨(5)天減少3,797例，下降12.2%，較上週五(12/30)略增61例，上升0.2%。確診數破千例縣市集中六都一縣，個案分布為新北市5,520例，台中市3,606例，高雄市3,066例，桃園市2,984例，台北市2,931例，台南市2,221例及彰化縣1,181例。
其餘縣市分布為新竹縣821例，新竹市785例，苗栗縣697例，屏東縣630例，雲林縣508例，嘉義縣403例，基隆市383例，宜蘭縣379例，南投縣362例，嘉義市265例，花蓮縣208例，台東縣134例，金門縣125例，澎湖縣65例及連江縣7例。
而62例死亡個案介於40歲至90多歲，56例具慢性病史、41例未接種3劑以上疫苗。截至目前累計確診人數站上900萬，達900萬7,371例，包含896萬5,293例本土病例，4萬2,024例境外移入，病歿人數為1萬5,445例。
第3波本土疫情升溫，長照機構染疫人數上揚，根據統計，上週新增354名工作人員及1,184名住民確診；老人福利機構、精神機構等，陽性率增幅超過1%以上。有鑑於此，中央流行疫情指揮中心宣布，自1月9日至1月31日期間，調整住宿式長照機構公費快篩措施，恢復住民1週2次篩檢，工作人員1週1次篩檢。
另外，近期出國人數遽增，「數位新冠病毒健康證明」的疫苗數位證明下載爆量，從去(2022)年11月每天平均約1萬2千件，提升至12月底每日平均約2萬件。疫情指揮中心提醒，數位證明與外交部領事局之間的護照資料自動交換機制並非及時更新，領取新護照後的更新資料，在隔天上午10時才會完成交換，因此民眾領到新護照後，要到隔日中午後，才可取得和新護照號碼一致的數位證明。
至於大陸入境來台旅客採檢情形，1月4日由桃園機場入境936人，其中218人陽性；松山機場入境263人，其中40人為陽性；台中機場入境1人為陰性，該班機為醫療專機來台；整體陽性率為21.5％。同時，疫情指揮中心首度發布基因定序結果，以BA.5.2、BF.7為主要變異株，也發現BA.5.1，均為常見且以往出現過的病毒。
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