秋冬新冠肺炎疫情緩升，流感帶來的威脅也不容小覷。疾管署公布，近7日(10/10~10/16)每日平均新增43例COVID-19確定病例，比前7日(10/3-10/9)每日平均新增39例回升；目前正是流感流行期，上週門急診類流感就診高達9萬386人次，且有40例流感併發重症。
近期檢出56例Omicron變異株確定病例，其中41例本土個案均為XBB；另15例境外移入個案分別為14例XBB及1例BA.2.86。而上週新增1例境外移入Omicron BA.2.86個案，於9月28日自土耳其入境，為國內首例檢出個案；本土病例尚無檢出BA.2.86變異株。而最近7日平均每天新增6例新冠肺炎死亡病例，較前7日每日死亡平均數3例上升。
疾管署表示，國內首次檢出BA.2.86變異株，為Omicron BA.2子代變異株，以目前疫情走勢預估，在10月中旬後還會緩步上升，在12月達到高峰，屆時每天確定病例推估有2.2萬至2.4萬例。
疾管署進一步指出，國內COVID-19疫情呈緩升趨勢，併發症中65歲以上長者占78%。鑒於國內外仍有疫情且以XBB為主流病毒株，為降低長者染疫後發生重症和死亡風險，提升國人對抗主流病毒株之免疫保護力，呼籲滿6個月以上民眾儘速前往接種XBB.1.5疫苗。
最近也是流感流行期，上週有40例流感併發重症，年齡介於未滿10歲至90多歲，發病日介於9月25日至10月12日，均未接種流感疫苗，其中35例具慢性病史。另外再添8例死亡，年齡介於未滿10歲至80多歲，發病日介於8月22日至10月8日，都有慢性病史，其中7例未接種流感疫苗。
根據疾管署統計，本(2023-24)流感季自10月1日起至16日累計54例，其中死亡5例、均為A型H3N2，上(2022-23)個流感季流感併發重症病例累計802例，以511例A型H1N1及272例A型H3N2為多，年齡層以65歲以上長者為主、占55%，有83%未接種流感疫苗，82%具慢性病史；其中死亡185例，72%未接種流感疫苗，95%有慢性病史。
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